Nawiązywanie kontaktów, mających na celu doprowadzenie do realizacji projektów i programów istotnych z punktu widzenia ochrony środowiska, było, jednym z najważniejszych, rutynowych działań Zarządu NFOŚ. W ramach bieżących czynności, Fundacja poszukiwała partnerów, którzy:
- zainteresowani byli finansowaniem określonych przedsięwzięć ekologicznych,
- potrzebowali wsparcia organizacyjnego, technicznego lub merytorycznego w realizacji własnych projektów oraz programów,
- potrzebowali wykonania konkretnych przedsięwzięć ekologicznych,
- byli zainteresowani wspólną realizacją projektów i programów ekologicznych,
- dysponowali rozwiązaniami, we wdrażaniu których zainteresowana była Fundacja.
Kontakty z potencjalnymi partnerami nawiązywane były w trakcie spotkań, konferencji, seminariów, w których uczestniczyli przedstawiciele Fundacji, jak również podczas zaplanowanych wizyt w instytucjach i organizacjach, działających w sferze ochrony środowiska.
Szczególnie dużo wysiłku poświęcono na nawiązanie lub kontynuowanie efektywnej współpracy, między innymi z:
- samorządami lokalnymi (w tym z urzędami marszałkowskimi oraz z urzędami gmin zainteresowanymi realizacją zadań z zakresu ochrony środowiska),
- administracją rządową wszystkich szczebli (w tym: z Ministerstwem Środowiska, Głównym Inspektoratem Ochrony Środowiska, Generalną Dyrekcją Ochrony Środowiska, regionalnymi dyrekcjami ochrony środowiska, wojewódzkimi inspektoratami ochrony środowiska),
- wyższymi uczelniami i jednostkami badawczo-rozwojowymi (w tym m.in. z Uniwersytetem Warszawskim, Szkołą Główną Gospodarstwa Wiejskiego, Instytutem Badawczym Leśnictwa, Instytutem Meteorologii i Gospodarki Wodnej, Instytutem Ochrony Przyrody PAN),
- parkami narodowymi i krajobrazowymi (w tym: ze wszystkimi parkami narodowymi oraz z kilkudziesięcioma parkami krajobrazowymi),
- instytucjami finansowymi zainteresowanymi działaniami na rzecz ochrony środowiska (w tym: z Narodowym Funduszem Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej, wojewódzkimi funduszami ochrony środowiska i gospodarki wodnej oraz do roku 2011 z Fundacją EkoFundusz),
- organizacjami społecznymi działającymi na rzecz poprawy stanu środowiska w Polsce.
