Od początku rozpoczęcia działalności Narodowej Fundacji Ochrony Środowiska w 1989 r. do wiodących jej kierunków należą inwentaryzacje przyrodnicze oraz monitoring przyrodniczy. Badania te są prowadzone w związku z przygotowywaniem planów ochrony i planów zadań ochronnych dla obszarów chronionych, raportów oddziaływania na środowisko, a także w związku z wieloma innymi potrzebami.
W ostatnich latach, obok wymienionych w osobnych zakładkach badań na potrzeby planów ochrony i raportów OOŚ, do najważniejszych projektów należą:
- Inwentaryzacja fauny i szaty roślinnej na trasie planowanej przebudowy drogi krajowej S8 na odcinku węzeł Walichnowy – węzeł Wrocław (A1) (2009 r.).
- Inwentaryzacji fauny i szaty roślinnej Obszaru Chronionego Krajobrazu „Dolina Noteci” w granicach gminy Margonin (2009 r.).
- Uproszczona inwentaryzacja przyrodnicza na trasie nowoprojektowanej drogi ekspresowej S6 na odcinku Lębork-obwodnica Trójmiasta (2009 r.).
- Inwentaryzacja ornitologiczna projektowanego obszaru specjalnej ochrony ptaków Natura 2000: Góry Izerskie i Sudety Wałbrzysko-Kamiennogórskie (2009 r.).
- Uzupełnienie inwentaryzacji przyrodniczej terenów przyległych do wybranego wariantu („Podstawowy+Rakowiska+Południowy” z wariantem „Dworek” i „Ryki”) nowoprojektowanej drogi ekspresowej S7 odcinek Koszwały-Kazimierzowo (2010 r.).
- Wykonanie ekspertyzy w zakresie oddziaływania planowanej do budowy drogi ekspresowej S3 na odcinku Gorzów Wlkp. – Nowa Sól na gatunki nietoperzy stanowiące przedmioty ochrony obszarów Natura 2000 PLH080003 Nietoperek, PLH080041 Skwierzyna, PLH080043 Sulechów (2010 r.).
- Przeprowadzenie monitoringu występowania i migracji płazów w ciągu autostrady A-4 na odcinku Zgorzelec (km 0+000,00) – Krzyżowa (km 51+400,00) (2010 r.).
- Wykonanie inwentaryzacji ornitologicznej dla PLB320019 Ostoja Drawska (2010 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby raportu oddziaływania na środowisko dla przedsięwzięcia polegającego na rozbudowie lotniska Szczytno – Szymany (2010 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na fragmentach drogi ekspresowej S7 na odcinku Miłomłyn-Olsztynek (2010 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na odcinku projektowanej obwodnicy Ostródy w ciągu drogi krajowej nr 16 od węzła Ostróda-Zachód do węzła Stare Jabłonki (2010 r.).
- Monitoring siedliska 3260 – nizinne i podgórskie rzeki ze zbiorowiskami włosieniczników w rzekach Czerna Wielka i Kwisa w ciągu autostrady A-4 Zgorzelec (km 0+000,00) – Krzyżowa (km 51+400,00) (2010 r.).
- Wykonanie inwentaryzacji ornitologicznej dla 2 obszarów specjalnej ochrony ptaków Natura 2000: PLB080002 Dolina Dolnej Noteci i PLB080001 Puszcza Barlinecka (2011 r.).
- Wykonanie inwentaryzacji ornitologicznej dla 2 obszarów specjalnej ochrony ptaków Natura 2000: PLB300006 Dolina Małej Wełny pod Kiszkowem i PLB040004 Ostoja Nadgoplańska (2011 r.).
- Liczenie nietoperzy w rezerwacie przyrody „Nietoperek” oraz w obiektach wolnostojących na obszarze Natura 2000 PLH080003 „Nietoperek” w styczniu 2011 roku jak również przeprowadzenie monitoringu warunków mikroklimatycznych w rezerwacie przyrody „Nietoperek” obejmujący cały system podziemny Centralnego Odcinka Międzyrzeckiego Rejonu Umocnionego wraz z liczeniem nietoperzy w części podziemi wchodzących w skład całorocznych tras turystycznych w rezerwacie przyrody „Nietoperek” (2011 r.).
- Prowadzenie nadzoru herpetologicznego w ramach realizacji ogrodzenia dla płazów w ciągu autostrady A4 na odcinku w okolicach Stawów Łagowskich (od km 3+350 do km 5+960) (2011 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza dla autostrady A1 na odcinku Tuszyn – Pyrzowice – Część III – odcinek projektowy nr 3 – węzeł Zawodzie (bez węzła) – węzeł Pyrzowice (bez węzła) (2011 r.).
- Inwentaryzacja ornitologiczna dla 2 obszarów OSO ptaków Natura 2000 Zalew Wiślany i Dolina Pasłęki (2012 r.).
- Inwentaryzacja ornitologiczna dla 2 obszarów OSO ptaków Natura 2000 Wielki Sandr Brdy i Dolina Dolnej Wisły (2012 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza projektowanej drogi ekspresowej S12 na odcinku Piotrków Trybunalski (A1) – Opoczno (gr. Woj. Mazowieckiego) oraz drogi ekspresowej S74 na odcinku Silejów (S12) – gr. Woj. Świętokrzyskiego (2012 r.).
- Inwentaryzacja bezkręgowców wzdłuż przebiegu analizowanych wariantów drogi S19 na odcinku od Kielanówki do Barwinka (warianty WB, WBalt, WA, WAalt i WBalt) (2013 r.).
- Ekspertyza przyrodnicza ptaków na potrzeby projektu PZO dla obszaru Natura 2000 Wielki Łęg Obrzański PLB30004 (2013 r.).
- Inwentaryzacja ornitologiczna obszarów Natura 2000: Dolina Samicy, Łęgi Odrzańskie, Dolina Baryczy, Góry Stołowe (2014 r.).
- Wykonanie inwentaryzacji przyrodniczej na potrzeby raportu OOŚ dla EJ (2015 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby raportu o oddziaływaniu przedsięwzięcia na środowisko w ramach ponownej oceny dla inwestycji pod nazwą „Budowa autostrady A2 Warszawa – Kukuryki na odcinku węzeł „Lubelska” – początek obwodnicy Mińska Mazowieckiego” (km 489+403 – 504+000) (2015 r.).
- Wykonanie monitoringu realizacji i efektywności działań kompensacyjnych w ramach inwestycji pn.: „Budowa drogi ekspresowej S-3 Szczecin-Gorzów Wlkp.” – 2 zadania (2015 r.).
- Monitoring ornitologiczny złoża Koźmin (2016 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby raportu OOŚ do wniosku o wydanie DUŚ dla budowy drugiej jezdni drogi ekspresowej S6 na obwodnicy Słupska (2016 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby raportu OOŚ do wniosku o wydanie DUŚ dla budowy obwodnicy Wodzisławia (2016 r.).
- Inwentaryzacja bezkręgowców, ryb oraz ssaków (z wyłączeniem nietoperzy) – Aktualizacja opracowań projektowych dla zadania pod nazwą: „Budowa drogi ekspresowej S-69 Bielsko-Biała – Żywiec – Zwardoń, odcinek Przybędza – Milówka (Obejście Węgierskiej Górki) (2016 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby aktualizacji dokumentacji projektowej oraz uzyskania decyzji o zezwoleniu na realizację inwestycji drogowej dla budowy Trasy „Krasińskiego” w Warszawie odc. Plac Wilsona do ul. Matki Teresy z Kalkuty wraz z przeprawą mostową i torowiskiem tramwajowym (2016 r.).
- Wykonanie charakterystyki środowiska biotycznego ulicy Nowej Politechnicznej w Gdańsku (2016 r.).
- Inwentaryzacja przyrodnicza na potrzeby raportu o oddziaływaniu przedsięwzięcia na środowisko do wniosku o wydanie decyzji o środowiskowych uwarunkowaniach dla budowy drogi ekspresowej S-10 na odcinku Bydgoszcz-Toruń (2017 r.).
- Wykonanie ekspertyz przyrodniczych w obszarach Natura 2000 Ostoja Iławska (2018 r.).
- Wykonanie ekspertyz przyrodniczych w obszarach Natura 2000 Ostoja Napiwodzko-Ramucka (2018 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o występowaniu i przedmiotach ochrony traszki grzebieniastej i kumaka nizinnego w obszarach Natura 2000:
Jeziora Wdzydzkie, Przywidz, Waćmierz, Dolna Wisła (2018 r.). - Wykonanie ekspertyzy na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o przedmiotach ochrony obszaru Natura 2000 Puszcza nad Gwdą – zimorodek (2019 r.).
- Wykonanie ekspertyzy ornitologicznej dla terenu zakładu produkcyjnego PKN Orlen w Płocku (2019 r.).
- Wykonanie ekspertyzy na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o przedmiotach ochrony obszarów Natura 2000: Warmińskie Buczyny – kumak nizinny, Mazurskie Bagna – lipiennik Loesela i haczykowiec błyszczący, Swajnie – sierpowiec błyszczący, kumak nizinny (2019 r.).
- Wykonanie ekspertyzy na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o przedmiotach ochrony obszarów Natura 2000: Ostoja Nadbużańska, Ostoja Nadliwiecka, Dolina Czarnej, Dolina Zwolenki (2020 r.).
- Ekspertyza teriologiczna w obszarze Natura 2000 Dolina Bystrzycy Łomnickiej i Wzgórza Strzelińskie (2020 r.).
- Ekspertyza chireptorologiczna w obszarach Natura 2000: Chłodnia w Cieszkowie, Kopalnie w Złotym Stoku, Las Pilczycki (2020 r.).
- Ekspertyzy: chiropetrologiczna w obszarach Natura 2000: Sztolnia w Młotach, Kiełczyn; teriologiczna: Źródła Pijawnika, Góry Złote; ornitologiczna: Sudety Wałbrzysko-Kamiennogórskie (2020 r.).
- Ekspertyza teriologiczna w obszarze Natura 2000 Karszówek (2020 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o występowaniu i przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000: Pradoliny Bzury-Neru (2020 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o występowaniu i przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000: Dolina Środkowej Pilicy (2020 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o występowaniu i przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000: Dolina Rawki (2020 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o występowaniu i przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000: Ostoja Przedborska (2020 r.).
- Uzupełnienie stanu wiedzy o traszce grzebieniastej w obszarze Natura 2000 Dolina Łupawy (2020 r.).
- Ekspertyza na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o wybranych przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000 Puszcza Kozienicka – mięczaki, nietoperze (2020 r.).
- Ekspertyzy przyrodnicze dla obszaru Natura 2000 Ostoja Borecka: bóbr i wydra, siedliska przyrodnicze i gatunki roślin (2020 r.).
- Ekspertyza przyrodnicza dla obszaru Natura 2000 Ostoja Wierzejska PLH260035 (2020 r.).
- Ekspertyza przyrodnicza dla obszaru Natura 2000 Uroczyska Lasów Starachowickich PLH260038 (2020 r.).
- Ekspertyza na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o gatunkach płazów oraz uwarunkowaniach ich ochrony w obszarze Natura 2000 Dolina Górnej Rospudy (2020 r.).
- Ekspertyza na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o wybranych przedmiotach ochrony w obszarze Natura 2000 Wielki Sandr Brdy – brodziec piskliwy i kania ruda (2021 r.).
- Wykonanie ekspertyzy na potrzeby uzupełnienia stanu wiedzy o przedmiotach ochrony obszaru Natura 2000: Dolina Noteci (2021 r.).
- Ekspertyza chireptorologiczna w obszarach Natura 2000: Kumaki Dobrej, Dolina Oleśnicy, Lasy Grądzińskie (2021 r.).
- Ekspertyza teriologiczna w obszarze Natura 2000 Przełomowa Dolina Nysy Łużyckiej (2021 r.).
